ردیابی گسترش نوع omicron در ایالات متحده و جهان



در نمودار جهانی متغیرهای کروناویروس زیر، علامت قرمز رنگ در گوشه سمت راست بالا در پایان نوامبر ظاهر می شود. این نمودار کشورهایی را نشان می‌دهد که توالی‌های ژنومی به صورت عمومی منتشر می‌شوند، بنابراین برخی از کشورهای بزرگ در آن گنجانده نشده‌اند. آزمایشگاه ها حدود یک هفته زمان می برند تا انواع ویروس را شناسایی کنند، بنابراین این داده ها همیشه دیر است. با استفاده از داده های در حال تغییر، مرکز کنترل و پیشگیری از بیماری ها تخمین زد که Omicron 98 درصد از موارد ویروسی کشور را در هفته گذشته به خود اختصاص داده است.

به اشتراک گذاری متغیرها در موارد سری در سراسر جهان

آلفا بتا دلتا گاما آهارون Omicron

دلتای آبی غول پیکر یک سال پیش شروع به گسترش کرد و تا تابستان جهان را فرا گرفت. Omicron سریعتر کنترل می شود.

نمودارهای زیر ترکیبی از انواع ویروس کرونا را در منتخبی از کشورهایی نشان می‌دهد که در حال حاضر سطوح بالایی از Omicron دارند. برای ثبت آخرین روندها، این نقشه از دوره های سه هفته ای استفاده می کند که آخرین آن شنبه گذشته به پایان می رسد. در یک کشور، توالی‌های ژنومی ممکن است در یک شیوع خاص متمرکز شوند، یا ممکن است برخی از شیوع‌ها نادیده گرفته شوند، بنابراین لزوماً نماینده کل کشور نیستند.

کشورهایی که Omicron در آنها برجسته ترین است

توالی یابی فرآیند ترسیم کد ژنتیکی یک ویروس خاص است که فرد را آلوده کرده است تا بتوان آن را با سویه های دیگر مقایسه کرد. ابزاری حیاتی برای ثبت تغییرات مهم است. اگر جهش ها به اندازه کافی ویروس را تغییر دهند، به یک نوع جدید تبدیل می شود. واریانت ها ممکن است رفتارهای متفاوتی داشته باشند که بر قابلیت انتقال ویروس تأثیر می گذارد و باعث می شود که از سیستم ایمنی بدن انسان فرار کند.

آزمایشگاه های دولتی و خصوصی نتایج توالی خود را به پایگاه داده جهانی GISAID، یک مشارکت غیرانتفاعی که روند بیماری های ویروسی را پخش می کند، ارسال می کنند.

[Understanding omicron’s many mutations]

فقط یک نمونه بسیار کوچک از موارد کرونا ترتیب داده شده است و این روند حدود یک هفته طول می کشد. این همیشه باعث می شود که مورد دوم در مقایسه با رکورد روزانه تعداد موارد ویروس با گسترش omicron کمی قدیمی شود.

اگرچه سطح توالی یابی در سراسر جهان و در ایالات متحده بسیار متفاوت است، بسیاری از کشورها در حال تولید نمونه های ژنوم عمومی کافی برای آشکار کردن این روند هستند.

کشورهایی که Omicron نیز در آنها رشد می کند

بسیاری از کشورها نمونه های کافی را به موقع برای داده های عمومی GISAID ارائه نکردند تا وضعیت شیوع omcron را نشان دهد. چین و روسیه بسیار اندک صادر کردند. در برخی موارد، ممکن است فناوری یا منابعی برای انجام توالی یابی ژنتیکی وجود نداشته باشد. در موارد دیگر، ممکن است در مورد شفافیت باشد.

تغییر جهت ایالات متحده

به اشتراک گذاری متغیرها در موارد سری در سراسر جهان

آلفا بتا دلتا گاما آهارون Omicron

توالی در ایالات متحده به طور گسترده ای متفاوت است. ماساچوست، کالیفرنیا، نیویورک، واشنگتن و آریزونا هزاران نمونه توالی یابی جمع آوری شده در ماه دسامبر را منتشر کردند. بسیاری از ایالت های دیگر صدها یا کمتر هستند. پست یک پست مورد به مورد از omicron منتشر می کند که داده ها کامل تر شود.

نوع دلتا برای اولین بار در اواخر سال ۲۰۲۰ در هند کشف شد و سپس به اروپا و بریتانیا گسترش یافت. در ماه جولای زمانی که موارد، بستری شدن در بیمارستان و مرگ و میر کاهش یافت، به ایالات متحده رسید. دلتا سریعتر از انواع قبلی گسترش یافت و به احتمال زیاد باعث ایجاد موارد پیشرفت در بین افراد واکسینه شده بود. به سرعت منجر به افزایش شدید موارد شد که در اوایل سپتامبر به اوج خود رسید. حتی با کاهش آن، نقطه پایین در اواخر اکتبر شش برابر بیشتر از نقطه پایین قبل از رسیدن به دلتا موارد داشت. در نوامبر، موارد در سراسر کشور با یک موج دلتای دیگر قبل از گسترش Omicron شروع به افزایش کردند.

این پروژه به روز خواهد شد.

لزلی شاپیرو و لئو دومینگز در این گزارش مشارکت کنید.